htsfilter

doi：10.18129/b9.bioc.htsfilter

这是发展htsfilter的版本；对于稳定版本，请参阅htsfilter。

滤波器复制的高通量转录组测序数据

生物导体版本：开发（3.16）

该软件包实现了基于全局JACCARD相似性指数的复制转录组测序数据的过滤过程，以识别一个或多个实验条件下表达水平较低的基因。

作者：Andrea Rau [Cre，Aut]，Melina Gallopin [CTB]，Gilles Celex [CTB]，FlorenceJaffrézic[CTB]

维护者：Andrea rau

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ htsfilter”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ htsfilter”）

html	R脚本	htsfilter
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	差异性，，，，基因表达，，，，免疫学，，，，正常化，，，，预处理，，，，rnaseq，，，，测序，，，，软件
版本	1.37.0
在生物导体中	Bioc 2.12（R-3.0）（9年）
执照	艺术2.0
要看	R（> = 4.0.0）
进口	EDGER，，，，deseq2，，，，生物比较，，，，生物酶，utils，统计，grdevices，图形，方法
链接
建议	EDASEQ，，，，测试，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，生物使用
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我	Coseq
建议我	htscluster
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	htsfilter_1.37.0.tar.gz
Windows二进制	htsfilter_1.37.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	htsfilter_1.37.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/htsfilter
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/htsfilter
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/htsfilter/
软件包下载报告	下载统计