htseqgenie

doi：10.18129/b9.bioc.htseqgenie

这是发展htseqgenie的版本;对于稳定版本，请参阅htseqgenie。

NGS分析管道。

生物导体版本：开发（3.16）

进行NGS分析的库。

作者：Gregoire Pau，Jens Reeder

维护者：Jens Reeder

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ htseqgenie”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

PDF		参考手册

细节

生物浏览	软件
版本	4.27.0
在生物导体中	Bioc 2.11（R-2.15）（9。5年）
执照	艺术2.0
要看	r（> = 3.0.0），GMAPR（> = 1.8.0），Shortread（> = 1.19.13），变体（> = 1.8.3）
进口	生物基因（> = 0.2.0），S4VECTORS（> = 0.9.25），iranges（> = 1.21.39），基因组机（> = 1.23.21），rsamtools（> = 1.8.5），生物弦（> = 2.24.1），chipseq（> = 1.6.1），HWRITER（> = 1.3.0），开罗（> = 1.5.5），GenomicFeatures（> = 1.9.31），生物比较，并行，工具，rtracklayer（> = 1.17.19），基因组签名，，，，变体工具（> = 1.7.7），GenomeInfodB，，，，总结性特征， 方法
链接
建议	txdb.hsapiens.ucsc.hg19，，，，肺部，，，，org.hs.eg.db
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包
Windows二进制
MacOS 10.13（高山脉）
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/htseqgenie
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/htseqgenie
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/htseqgenie/
软件包下载报告	下载统计