htqpcr

doi：10.18129/b9.bioc.htqpcr

这是发展HTQPCR的版本;对于稳定版本，请参阅htqpcr。

高通量QPCR数据的自动分析

生物导体版本：开发（3.16）

分析来自多种条件或重复的高吞吐量实时PCR（QPCR）测定的CT值。输入数据可以来自空间定义的格式，例如Abi Taqman低密度阵列或OpenArray；罗氏应用科学的Lightcycler；来自Bio-Rad实验室的CFX板；常规的96或384孔板；或微流体设备，例如Fluidigm Corporation的动态阵列。HTQPCR处理数据加载，质量评估，归一化，可视化以及参数或非参数测试，以在特征之间的CT值（例如基因，microRNA）之间进行统计显着性。

作者：Heidi Dvinge，Paul Bertone

维护者：fredhutch.org> Heidi dvinge

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version ='devel'）biocmanager :: install（“ htqpcr”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ htqpcr”）

PDF	R脚本	R中的QPCR分析
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	DataImport，，，，差异性，，，，基因表达，，，，MicrotReplateassay，，，，多重组合，，，，预处理，，，，QualityControl，，，，软件，，，，可视化，，，，qpcr
版本	1.51.0
在生物导体中	Bioc 2.5（R-2.10）（12。5年）
执照	艺术2.0
要看	生物酶，，，，rcolorbrewer，，，，林玛
进口	副词，，，，生物酶，，，，GPLOTS，图形，grdevices，林玛， 方法，rcolorbrewer，Stats，Stats4，Utils
链接
建议	Statmod
系统要求
增强
URL	http://www.ebi.ac.uk/bertone/software
取决于我
进口我	无索引，，，，unifiedwmwqpcr
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	htqpcr_1.51.0.tar.gz
Windows二进制	htqpcr_1.51.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	htqpcr_1.51.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/htqpcr
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/htqpcr
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/htqpcr/
软件包下载报告	下载统计