刺激性

doi：10.18129/b9.bioc.harshlight

这是发展Harshlight的版本；对于稳定版本，请参阅刺激性。

微阵列芯片的“矫正化妆”程序

生物导体版本：开发（3.16）

该软件包用于检测微阵列芯片上的扩展，扩散和紧凑的斑点。Harshlight会自动标记芯片集合（AffyBatch对象）中的区域，并返回校正后的AffyBatch对象，其中缺陷区域用NAS代替NAS或集合中其他芯片中同一探针的值中位数。新版本将替代值作为整个矩阵处理以解决内存问题。

作者：Mayte Suarez-Farinas，Maurizio Pellegrino，Knut M. Wittkowski，Marcelo O. Magnasco

维护者：毛里齐奥·佩莱格里诺（Maurizio Pellegrino）

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（decon ='devel'）biocmanager :: install（“ harshlight”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“刺激”）

PDF	R脚本	刺激性
PDF		参考手册

细节

生物浏览	微阵列，，，，Onechannel，，，，预处理，，，，QualityControl，，，，报告写作，，，，软件
版本	1.69.0
在生物导体中	Bioc 1.9（R-2.4）（15。5年）
执照	GPL（> = 2）
要看	R（> = 2.10）
进口	副词，，，，altcdfenvs，，，，生物酶，统计，utils
链接
建议
系统要求
增强
URL	http://asterion.rockefeller.edu/harshlight/
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	Harshlight_1.69.0.tar.gz
Windows二进制	harshlight_1.69.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	Harshlight_1.69.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/harshlight
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/恶劣
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/harshlight/
软件包下载报告	下载统计