这是发展IHW版本;稳定发布版本请参见IHW.
Bioconductor版本:开发(3.16)
独立假设加权(IHW)是一种多重检验程序,通过为每个假设分配数据驱动的权重,比Benjamini和Hochberg的方法更有效。IHW的输入是一个两列的p值和协变量表。协变量可以是任何连续值或分类变量,这些变量被认为对每个假设检验的统计特性提供信息,而它与零假设下的p值无关。
作者:Nikos Ignatiadis [aut, cre], Wolfgang Huber [aut]
维护者:Nikos Ignatiadis < Nikos。Ignatiadis01在gmail.com>
引用(从R中,输入引用(“IHW”)
):
要安装此包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用bio devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("IHW")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“IHW”)
超文本标记语言 | R脚本 | IHW简介 |
参考手册 |
biocViews | ImmunoOncology,MultipleComparison,RNASeq,软件 |
版本 | 1.25.0 |
在Bioconductor公司 | BioC 3.3 (R-3.3)(6年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 3.3.0) |
进口 | 方法,大满贯,lpsymphony,fdrtool,BiocGenerics |
链接 | |
建议 | ggplot2,dplyr,gridExtra,尺度,DESeq2,气道,testthat,矩阵,BiocStyle,knitr,rmarkdown,devtools |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | IHWpaper |
进口我 | 理想的 |
建议我 | BloodCancerMultiOmics2017,DEWSeq,GRaNIE,metagenomeSeq,SummarizedBenchmark |
给我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | IHW_1.25.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS 10.13 (High Sierra) | IHW_1.25.0.tgz |
源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/IHW |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/IHW |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/IHW/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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