检查

doi:10.18129/b9.bioc

这是发展Inspect的版本;对于稳定版本,请参阅检查

用RNA-Seq数据建模RNA合成,加工和降解

生物导体版本:开发(3.16)

检查(从转录组数据中推断合成,处理和降解速率)在时间课程或稳态条件下RNA-Seq数据,无论是否支持新生的RNA数据。

作者:Stefano de Pretis

维护者:stefano de Pretis ,mattia furlan

引用(从r内,输入引用(“检查”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(decon ='devel')biocmanager :: install(“ Inspect”)的用法

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“检查”)

html R脚本 检查 - 从转录组数据推断合成,处理和降解率
html R脚本 Inspect_Gui.html
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 结肠管制,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件,,,,系统生物学,,,,时间科
版本 1.27.0
在生物导体中 Bioc 3.2(R-3.2)(6。5年)
执照 GPL-2
要看 R(> = 3.6),方法,生物酶,,,,生物比较
进口 Proc,,,,脱落,,,,Rootsolve,,,,克恩斯门茶,,,,gdata,,,,GenomicFeatures,,,,基因组机,,,,iranges,,,,生物基因,,,,基因组签名,,,,rsamtools,,,,S4VECTORS,,,,GenomeInfodB,,,,deseq2,,,,plgem,,,,rtracklayer,,,,总结性特征,,,,txdb.mmusculus.ucsc.mm9,,,,闪亮的
链接
建议 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Inspect_1.27.0.tar.gz
Windows二进制 Inspect_1.27.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) Inspect_1.27.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/inspect
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/检查
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/inspect/
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