这是发展ivas的版本;对于稳定版本,请参阅IVAS。
生物导体版本:开发(3.16)
鉴定影响替代剪接的遗传变异。
作者:Seonggyun Han,Sangsoo Kim
维护者:Seonggyun Han
引用(从r内,输入引用(“ ivas”)):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ ivas”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Ivas”)
| R脚本 | IVA:鉴定影响替代剪接的遗传变异 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
| 生物浏览 | 替代方案,,,,差异性,,,,差速器,,,,基因表达,,,,结肠管制,,,,免疫学,,,,rnaseq,,,,回归,,,,SNP,,,,测序,,,,软件,,,,转录 |
| 版本 | 2.17.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.1(R-3.2)(7年) |
| 执照 | GPL-2 |
| 要看 | R(> 3.0.0),GenomicFeatures,,,,GGPLOT2,,,,生物酶 |
| 进口 | 多帕尔,,,,LME4,,,,生物基因,,,,基因组机,,,,iranges,,,,foreach,,,,AnnotationDbi,,,,S4VECTORS,,,,GenomeInfodB,,,,Ggfortify,grdevices,方法,矩阵,,,,生物比较,utils,统计 |
| 链接 | |
| 建议 | 生物使用 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | IMAS |
| 进口我 | Aspediafi |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | ivas_2.17.0.tar.gz |
| Windows二进制 | ivas_2.17.0.zip |
| MacOS 10.13(高山脉) | ivas_2.17.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ivas |
| 源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/ivas |
| 包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/ivas/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
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