兴趣

doi：10.18129/b9.bioc.interest

这是发展感兴趣的版本；对于稳定版本，请参阅兴趣。

内含子 - 外观保留估计器

生物导体版本：开发（3.16）

该软件包对RNA-seq数据（.bam Files）进行内含子外观保留分析。

作者：ali oghabian ，dario greco ，mikko frilander frilander>

维护者：Ali Oghabian ，Mikko Frilander

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（decon ='devel'）biocmanager :: install（“兴趣”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“利益”）

html	R脚本	兴趣，内含子外显子保留估计器
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	结盟，，，，替代方案，，，，覆盖范围，，，，差异性，，，，差速器，，，，免疫学，，，，正常化，，，，rnaseq，，，，测序，，，，软件
版本	1.21.1
在生物导体中	Bioc 3.5（R-3.4）（5年）
执照	GPL-2
要看	r（> = 3.5.0），基因组机，，，，rsamtools，，，，总结性特征，，，，EDGER，，，，S4VECTORS
进口	seqlogo，，，，生物弦，，，，GenomicFeatures（> = 1.39.4），iranges，，，，seqinr，图形，grdevices，Stats，Utils，网格，方法，DBI，，，，rmysql，，，，基因组签名，，，，生物比较，，，，生物基因，，，，dexseq，，，，deseq2
链接
建议	Clinfun，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	ivey_1.21.1.tar.gz
Windows二进制	兴趣_1.21.1.zip（仅64位）
MacOS 10.13（高山脉）	利息_1.21.1.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/interest
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：套餐/兴趣
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/interest/
软件包下载报告	下载统计