互动集

doi：10.18129/b9.bioc.intractionset

这是发展Interactionset的版本；对于稳定版本，请参阅互动集。

存储基因组相互作用数据的基础类

生物导体版本：开发（3.16）

提供Ginteractions，Intercontionset和Contactionset和Contactmatrix对象以及相关的方法，用于存储和操纵HI-C和CHIA-PET实验的基因组相互作用数据。

作者：Aaron Lun [AUT，CRE]，Malcolm Perry [AUT]，Elizabeth Ingmmons [aut]

维护者：aaron lun

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ InteractionSet”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ Interactionset”）

html	R脚本	基因组相互作用类别
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	datarepresentation，，，，嗝，，，，基础设施，，，，软件
版本	1.25.0
在生物导体中	Bioc 3.3（R-3.3）（6年）
执照	GPL-3
要看	基因组机，，，，总结性特征
进口	方法，矩阵，，，，RCPP，，，，生物基因，，，，S4VECTORS（> = 0.27.12），iranges，，，，GenomeInfodB
链接	RCPP
建议	测试，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，生物使用
系统要求	C ++ 11
增强
URL
取决于我	Diffhic，，，，基因组间，，，，Macpet，，，，nullrangesdata，，，，塞文
进口我	Cagefightr，，，，Chippeakanno，，，，伸出，，，，Hiccompare，，，，hicdcplus，，，，nullranges，，，，TrackViewer
建议我	CageWorkFlow，，，，Plotgardener，，，，updateObject
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	Interactionset_1.25.0.tar.gz
Windows二进制	Interactionset_1.25.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	Interactionset_1.25.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/interactionset
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/互动集
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/interactionset/
软件包下载报告	下载统计