KinSwingR

DOI:10.18129 / B9.bioc.KinSwingR

这是发展KinSwingR版本;稳定版请参见KinSwingR

KinSwingR:基于网络的激酶活性预测

Bioconductor版本:开发(3.16)

KinSwingR集成了来自质谱数据和激酶底物预测的磷酸数据来预测激酶活性。几个功能允许用户建立激酶底物的PWM模型,统计推断PWM:底物匹配,并整合这些数据来推断激酶活性。

作者:Ashley J. Waardenberg [aut, cre]

维护者:Ashley J. Waardenberg

引文(从R内,输入引用(“KinSwingR”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("KinSwingR")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“KinSwingR”)

超文本标记语言 R脚本 KinSwingR
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 网络蛋白质组学SequenceMatching软件
版本 1.15.0
在Bioconductor BioC 3.8 (R-3.5)(4年)
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 3.5)
进口 data.tableBiocParallelsqldf,统计,网格,grDevices
链接
建议 knitrrmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 KinSwingR_1.15.0.tar.gz
Windows二进制 KinSwingR_1.15.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) KinSwingR_1.15.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/KinSwingR
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/KinSwingR
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/KinSwingR/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一: