这是发展KinSwingR版本;稳定版请参见KinSwingR.
Bioconductor版本:开发(3.16)
KinSwingR集成了来自质谱数据和激酶底物预测的磷酸数据来预测激酶活性。几个功能允许用户建立激酶底物的PWM模型,统计推断PWM:底物匹配,并整合这些数据来推断激酶活性。
作者:Ashley J. Waardenberg [aut, cre]
引文(从R内,输入引用(“KinSwingR”)
):
要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("KinSwingR")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“KinSwingR”)
超文本标记语言 | R脚本 | KinSwingR |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 网络,蛋白质组学,SequenceMatching,软件 |
版本 | 1.15.0 |
在Bioconductor | BioC 3.8 (R-3.5)(4年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 3.5) |
进口 | data.table,BiocParallel,sqldf,统计,网格,grDevices |
链接 | |
建议 | knitr,rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | KinSwingR_1.15.0.tar.gz |
Windows二进制 | KinSwingR_1.15.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | KinSwingR_1.15.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/KinSwingR |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/KinSwingR |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/KinSwingR/ |
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