中长期规划

DOI:10.18129 / B9.bioc.MLP

这是发展中长期规划的版本;稳定的发布版本,请参阅中长期规划。

意味着日志P分析

Bioconductor版本:发展(3.16)

通路分析基于假定值相关基因的基因表达分析的兴趣。效用函数可以从基因本体中提取途径生物过程(GOBP),分子功能(GOMF)和细胞组件(GOCC),京都基因的基因组百科全书(KEGG)和Reactome数据库。方法,并辅助函数来显示结果表,barplot途径的意义,基因本体图和路径意义是可用的。

作者:Nandini Raghavan (aut),托拜厄斯韦贝克(aut),损坏:De Bondt一(aut)哈维尔·卡布瑞拉(施),Dhammika Amaratunga[所有],齿Casneuf[所有],威廉Ligtenberg[所有],罗兰Cougnaud (cre) Katarzyna Gorczak(施)

维护人员:Tobias韦贝克<托拜厄斯。韦贝克在openanalytics.eu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“延时”)

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文档

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browseVignettes(“延时”)

PDF	R脚本	UsingMLP
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	去,GeneExpression,遗传学,KEGG,通路,Reactome,软件
版本	1.45.0
Bioconductor自	BioC 2.8 (r - 2.13)(11.5年)
许可证	GPL-3
取决于
进口	AnnotationDbi,gplots、图形数据,跑龙套
链接
建议	GO.db,org.Hs.eg.db,org.Mm.eg.db,org.Rn.eg.db,org.Cf.eg.db,org.Mmu.eg.db,KEGGREST,注释,Rgraphviz,GOstats,图,limma,mouse4302.db,reactome.db
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我	esetVis
建议我	a4
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	MLP_1.45.0.tar.gz
Windows二进制	MLP_1.45.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	MLP_1.45.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MLP
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/延时
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/MLP/
包下载报告	下载数据