MSSTATSPTM

doi：10.18129/b9.bioc.msstatpm

这是发展MSSTATSPTM的版本;对于稳定版本，请参阅MSSTATSPTM。

翻译后修饰的统计表征

生物导体版本：开发（3.16）

MSSTATSPTM提供了通用统计方法，用于定量翻译后修饰（PTMS）的定量表征。支持DDA，DIA和串联质量标签（TMT）标签。通常，分析涉及对PTM位点（即修饰残基）及其相应蛋白质的定量，以及定量结果的整合。MSSTATSPTM提供了用于汇总，PTM位点丰度估计以及在实验条件跨PTM的变化的功能。

作者：德文·科勒[AUT，CRE]，Tsung-heng Tsai [aut]，Ting Huang [aut]，Mateusz Staniak [aut]，Meena Choi [aut]，Olga Vitek [aut]

维护者：德文·科勒（Devon Kohler）

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version ='devel'）biocmanager :: install（“ msstatsptm”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ MSSTATSPTM”）

html	R脚本	MSSTATSPTM Labelfree工作流程
html	R脚本	MSSTATSPTM TMT工作流程
PDF		参考手册

细节

生物浏览	差异性，，，，免疫学，，，，质谱，，，，正常化，，，，Onechannel，，，，蛋白质组学，，，，QualityControl，，，，软件，，，，两通道
版本	1.7.0
在生物导体中	Bioc 3.12（R-4.0）（1。5年）
执照	艺术2.0
要看	R（> = 4.0）
进口	dplyr，，，，栅格，，，，Stringr，统计GGPLOT2，grdevices，MSSTATSTMT，，，，MSSTATSConvert，，，，MSSTATS，，，，Data.Table，，，，RCPP，，，，生物弦，，，，检查员，，，，Ggrepel
链接	RCPP
建议	生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，很小的测试，，，，COVR
系统要求
增强
URL
BugReports	https://github.com/vitek-lab/msstatpm/issues
取决于我
进口我	MSSTATSLIP
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	MSSTATSPTM_1.7.0.TAR.GZ
Windows二进制	MSSTATSPTM_1.7.0.ZIP
MacOS 10.13（高山脉）	MSSTATSPTM_1.7.0.TGZ
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/msstatsptm
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/msstatsptm
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/msstatsptm/
软件包下载报告	下载统计