母子

doi：10.18129/b9.bioc.matrixrider

这是发展Matrixrider的版本;对于稳定版本，请参阅母子。

在给定序列上获得结合位点矩阵的总亲和力和占用

生物导体版本：开发（3.16）

为整个序列计算一个数字，该数字反映了DNA结合蛋白与其相互作用的倾向。DNA结合蛋白必须用PFM基质来描述，例如从Jaspar获得。

作者：Elena Grassi

维护者：elena grassi

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version ='devel'）biocmanager :: install（“ matrixrider”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ matrixrider”）

PDF	R脚本	总亲和力和占领
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	结肠管制，，，，遗传学，，，，图案，，，，软件
版本	1.29.0
在生物导体中	Bioc 3.1（R-3.2）（7年）
执照	GPL-3
要看	R（> = 3.1.2）
进口	方法，TFBSTOOLS，，，，iranges，，，，xvector，，，，生物弦
链接	iranges，，，，xvector，，，，生物弦，，，，S4VECTORS
建议	运行，，，，生物基因，，，，生物使用，，，，Jaspar2014
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	matrixrider_1.29.0.tar.gz
Windows二进制	matrixrider_1.29.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	matrixrider_1.29.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/matrixrider
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/matrixrider
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/matrixrider/
软件包下载报告	下载统计