metavolcanor

doi：10.18129/b9.bioc.metavolcanor

这是发展Metavolcanor的版本；对于稳定版本，请参阅metavolcanor。

基因表达荟萃分析可视化工具

生物导体版本：开发（3.16）

Metavolcanor结合了差异基因表达结果。它实现了三种策略来总结不同研究的差异基因表达。i）随机效应模型（REM）方法，ii）合并答复的P值，iii）一种投票计数方法。在所有情况下，Metavolcano都利用火山图推理可视化基因表达荟萃分析结果。

作者：Cesar Prada [AUT，CRE]，Diogenes Lima [AUT]，Helder Nakaya [Aut，THS]

维护者：cesar prada

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ metavolcanor”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Metavolcanor”）

html	R脚本	metavolcanor输入：差分表达示例
html	R脚本	metavolcanor：差分表达荟萃分析工具
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	差异性，，，，基因表达，，，，rnaseq，，，，软件，，，，转录组学，，，，Mrnamicroarray
版本	1.11.0
在生物导体中	Bioc 3.10（R-3.6）（2。5年）
执照	GPL-3
要看	R（> = 4.1.1）
进口	方法，Data.Table，，，，dplyr，，，，花花公子，，，，情节，，，，GGPLOT2，，，，牛仔图， 平行，元，，，，代码，，，，rlang，，，，TopConfects，grdevices，图形，统计信息，htmlwidgets
链接
建议	尼特，，，，降价，，，，rmarkDown，，，，测试
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	metavolcanor_1.11.0.tar.gz
Windows二进制	metavolcanor_1.11.0.zip（仅64位）
MacOS 10.13（高山脉）	metavolcanor_1.11.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/metavolcanor
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/metavolcanor
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/metavolcanor/
软件包下载报告	下载统计