甲基赛克

doi：10.18129/b9.bioc.methylseekr

这是发展甲基赛克的版本；对于稳定版本，请参阅甲基赛克。

BIS-SEQ数据的分割

生物导体版本：开发（3.16）

这是从BIS-SEQ数据发现监管区域的软件包

作者：Lukas Burger，Dimos Gaidatzis，Dirk Schubeler和Michael Stadler

维护者：lukas Burger

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化了Bioc Devel Biocmanager :: install（version ='devel'）biocmanager :: install（“ edimylseekr”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“甲基赛克”）

PDF	R脚本	甲基赛克
PDF		参考手册

细节

生物浏览	DNAMETHYLATY，，，，甲基，，，，测序，，，，软件
版本	1.37.0
在生物导体中	Bioc 2.12（R-3.0）（9年）
执照	GPL（> = 2）
要看	rtracklayer（> = 1.16.3），并行（> = 2.15.1），MHSMM（> = 0.4.4）
进口	iranges（> = 1.16.3），BSGENOME（> = 1.26.1），基因组机（> = 1.10.5），Geneplotter（> = 1.34.0），图形（> = 2.15.2），grdevices（> = 2.15.2），并行（> = 2.15.2），stats（> = 2.15.2），utils（> = 2.15。2）
链接
建议	bsgenome.hsapiens.ucsc.hg18
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我	甲基管，，，，rnbeads
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	甲基Seekr_1.37.0.tar.gz
Windows二进制	甲基Seekr_1.37.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	甲基Seekr_1.37.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/methylseekr
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/ethylseekr
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/methylseekr/
软件包下载报告	下载统计