MinimumDistance

DOI:10.18129 / B9.bioc.MinimumDistance

这是发展MinimumDistance版本;稳定发布版本请参见MinimumDistance．

Case-Parent三元组中De Novo CNV检测包

Bioconductor版本:开发(3.16)

来自高维基因分型平台的三组从头拷贝数变异分析。

作者:Robert B Scharpf和Ingo Ruczinski

维护者:Robert Scharpf

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用bio devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("MinimumDistance")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“MinimumDistance”)

PDF	R脚本	检测病例-父系三胞胎中新生拷贝数的改变
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CopyNumberVariation，微阵列，单核苷酸多态性，软件
版本	1.41.0
Bioconductor自	BioC 2.10 (R-2.15)(10年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.5.0),VanillaICE(> = 1.47.1)
进口	方法,BiocGenerics，MatrixGenerics，Biobase，S4Vectors(> = 0.23.18),IRanges，GenomeInfoDb，GenomicRanges(> = 1.17.16),SummarizedExperiment(> = 1.15.4),oligoClasses，DNAcopy，ff，foreach，matrixStats，晶格，data.table，网格，统计，效用
链接
建议	human610quadv1bCrlmm(> = 1.0.3),BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19，RUnit
SystemRequirements
增强了	雪，doSNOW
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	MinimumDistance_1.41.0.tar.gz
Windows二进制	MinimumDistance_1.41.0.zip(64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	MinimumDistance_1.41.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MinimumDistance
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MinimumDistance
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/MinimumDistance/
包下载报告	下载数据