msbackendmsp

doi:10.18129/b9.bioc.msbackendmsp

这是发展MSBACKENDMSP的版本;对于稳定版本,请参阅msbackendmsp

NIST MSP文件的质谱数据后端

生物导体版本:开发(3.16)

质谱(MS)数据后端支持从NIST MSP格式(MSP)文件导入和处理MS/MS光谱。支持从具有不同MSP *口味 *的文件导入数据。此软件包中的对象将对MSP文件的支持添加到BioConductor的Spectra软件包中。因此,如果没有Spectra软件包,该软件包不应使用,该软件包为MS数据处理提供了完整的基础架构。

作者:Neumann Steffen [AUT],约翰内斯·雷纳[AUT,CRE],迈克尔·威特(Michael Witting)[CTB]

维护者:约翰内斯·雷纳(Johannes Rainer)

引用(从r内,输入引用(“ msbackendmsp”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version ='devel')biocmanager :: install(“ msbackendmsp”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ msbackendmsp”)

html R脚本 msbackendmsp
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 DataImport,,,,基础设施,,,,质谱,,,,代谢组学,,,,蛋白质组学,,,,软件
版本 1.1.0
在生物导体中 Bioc 3.15(R-4.2)(<6个月)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 4.1.0),光谱(> = 1.5.14)
进口 生物比较,,,,S4VECTORS,,,,iranges,,,,mscoreutils,方法,统计
链接
建议 测试,,,,尼特(> = 1.1.0),roxygen2,,,,生物使用(> = 2.5.19),rmarkDown
系统要求
增强
URL https://github.com/rformassspectrometry/msbackendmsp
BugReports https://github.com/rformassspectrometry/msbackendmsp/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 msbackendmsp_1.1.0.tar.gz
Windows二进制 msbackendmsp_1.1.0.zip(仅64位)
MacOS 10.13(高山脉) msbackendmsp_1.1.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/msbackendmsp
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/msbackendmsp
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/msbackendmsp/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题: