NOISeq

DOI:10.18129 / B9.bioc.NOISeq

这是发展NOISeq版本;稳定发布版本请参见NOISeq

RNA-seq数据的探索性分析和差异表达

Bioconductor版本:开发(3.16)

RNA-seq表达数据或其他类似数据的分析。探索图来评估饱和度,计数分布,每个染色体的表达,检测特征的类型,特征的长度等。无参数假设的两种实验条件的微分表达式。

作者:Sonia Tarazona, Pedro Furio-Tari, Maria Jose Nueda, Alberto Ferrer和Ana Conesa

维护者:Sonia Tarazona

引用(从R中,输入引用(“NOISeq”)):

安装

要安装此包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("NOISeq")

对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“NOISeq”)

PDF R脚本 NOISeq用户指南
PDF QCreport.pdf
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DifferentialExpressionImmunoOncologyRNASeq测序软件可视化
版本 2.41.0
Bioconductor自 BioC 2.11 (R-2.15)(10年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R(>= 2.13.0),方法,Biobase(>= 2.13.11),样条曲线(>= 3.0.1),矩阵(> = 1.2)
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我 metaSeq
进口我 CNVPanelizerExpHunterSuite
建议我 compcodeR
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包 NOISeq_2.41.0.tar.gz
Windows二进制 NOISeq_2.41.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) NOISeq_2.41.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/NOISeq
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ NOISeq
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/NOISeq/
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