Nanostringdiff

doi：10.18129/b9.bioc.nanostringdiff

这是发展Nanostringdiff的版本；对于稳定版本，请参阅Nanostringdiff。

纳米弦ncounter数据的差异表达分析

生物导体版本：开发（3.16）

该软件包利用负二项式家族的广义线性模型（GLM）来表征计数数据并允许多因素设计。Nanostrongdiff结合了根据模型框架中从负面对照获得的阳性对照和管家控制和背景水平计算出的尺寸因子，以便完全利用NanoString Ncounter Analyzer提供的所有归一化信息。

作者：hong wang ，tingting zhai ，chi wang

维护者：tingting zhai ，hong wang

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version（version ='Devel'）Biocmanager :: install（“ nanostringdiff”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“纳米式”

PDF	R脚本	Nanostringdiff Vignette
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	差异性，，，，正常化，，，，软件
版本	1.27.0
在生物导体中	Bioc 3.2（R-3.2）（6。5年）
执照	GPL
要看	生物酶
进口	矩阵， 方法，RCPP
链接	RCPP
建议	测试，，，，生物使用
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我	纳米管
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	nanostringdiff_1.27.0.tar.gz
Windows二进制	nanostringdiff_1.27.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	nanostringdiff_1.27.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/nanostringdiff
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/nanostringdiff
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/nanostringdiff/
软件包下载报告	下载统计