纳米林区

doi:10.18129/b9.bioc.nanostringnctools

这是发展Nanostringnctools的版本;对于稳定版本,请参阅纳米林区

Nanostring ncounter工具

生物导体版本:开发(3.16)

纳米弦技术的工具NCounter技术。为将RCC文件读取到表达式派生对象中提供支持。还包括用于QC和纳米串数据范围的方法。

作者:帕特里克·奥波耶(Patrick Aboyoun)[aut],妮可·奥托格罗(Nicole Ortogero

维护者:nanostring.com>

引用(从r内,输入引用(“纳米弦乐”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化了Bioc Devel Biocmanager :: install(version = decon ='devel')biocmanager :: install(“ nanostringnctools”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“纳米stringnctools”)

html R脚本 Nanostringrccset课程简介
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 蜂窝基,,,,DataImport,,,,基因表达,,,,专有Platratforms,,,,蛋白质组学,,,,rnaseq,,,,软件,,,,转录,,,,转录组学,,,,Mrnamicroarray
版本 1.5.0
在生物导体中 Bioc 3.13(R-4.1)(1年)
执照 麻省理工学院
要看 r(> = 3.6),生物酶,,,,S4VECTORS,,,,GGPLOT2
进口 生物基因,,,,生物弦,,,,ggbeeswarm,,,,Ggiraph,,,,ggthemes,grdevices,iranges, 方法,pheatmap,,,,rcolorbrewer,统计,utils
链接
建议 Biovizbase,,,,GGBIO,,,,运行,,,,rmarkDown,,,,尼特,,,,QPDF
系统要求
增强
URL
取决于我 Geomxtools,,,,GEOMXWORKFLOWS
进口我 地球夫
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 nanostringnctools_1.5.0.tar.gz
Windows二进制 nanostringnctools_1.5.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) nanostringnctools_1.5.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/nanostringnctools
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/nanostringnctools
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/nanostringnctools/
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