星云

doi：10.18129/b9.bioc.nebulosa

这是发展Nebulosa的版本；对于稳定版本，请参阅星云。

使用内核基因加权密度估计的单细胞数据可视化

生物导体版本：开发（3.16）

该软件包基于基因加权密度估计，可以增强对单细胞数据的可视化。Nebulosa从掉落的特征中恢复信号，并允许从多个特征（例如基因）检查关节表达式。Nebulosa内可以使用seurat和Singlecellexperiment对象。

作者：Jose Alquicira-Hernandez [AUT，CRE]

维护者：jose alquicira-hernandez

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ nebulosa”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Nebulosa”）

html	R脚本	用星云可视化基因表达
html	R脚本	用星云（在Seurat中）可视化基因表达
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	维度，，，，基因表达，，，，Singlecell，，，，软件，，，，可视化
版本	1.7.0
在生物导体中	Bioc 3.12（R-4.0）（1。5年）
执照	GPL-3
要看	r（> = 4.0），GGPLOT2，，，，拼布
进口	Seurat，，，，Singlecellexperiment，，，，总结性特征，，，，KS，，，，矩阵，统计，方法
链接
建议	测试，，，，生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，COVR，，，，评分，，，，斯克兰，，，，液滴，，，，Igraph，，，，Biocfilecache，，，，seuratObject
系统要求
增强
URL	https://github.com/powellgenomicslab/nebulosa
BugReports	https://github.com/powellgenomicslab/nebulosa/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	nebulosa_1.7.0.tar.gz
Windows二进制	nebulosa_1.7.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	nebulosa_1.7.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/nebulosa
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/nebulosa
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/nebulosa/
软件包下载报告	下载统计