食人魔

DOI:10.18129 / B9.bioc.OGRE

这是发展版本的怪物;稳定的发布版本,请参阅食人魔。

计算、可视化和分析基因重叠区域

Bioconductor版本:发展(3.16)

怪物数据集计算重叠用户定义的基因组区域。任何地区都可以提供即基因单核苷酸多态性,或读取从测序实验。关键数据帮助分析重叠的扩展也可以可视化在基因组水平上。

作者:斯文berr (aut (cre), Jorg Gromoll[所有],马吕斯Woste[所有],莎拉Sandmann[所有],桑德拉Laurentino(施)

维护人员:斯文berr < svenbioinf gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“食人魔”)

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文档

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HTML	R脚本	食人魔
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释,BiologicalQuestion,宏基因组,测序,软件,可视化,WorkflowStep
版本	1.1.0
Bioconductor自	BioC 3.15 (r - 4.2)(< 6个月)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 4.1.0),S4Vectors
进口	GenomicRanges、方法、data.table,为了,ggplot2,Gviz,IRanges,AnnotationHubgrDevices统计数据,GenomeInfoDb,闪亮的,shinyFiles,DT,rtracklayer,shinydashboard,shinyBS,tidyr
链接
建议	testthat(> = 3.0.0),knitr(> = 1.36),rmarkdown(> = 2.11)
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/svenbioinf/OGRE/
BugReports	https://github.com/svenbioinf/OGRE/issues
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	OGRE_1.1.0.tar.gz
Windows二进制	OGRE_1.1.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	OGRE_1.1.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/OGRE
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/怪物
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/OGRE/
包下载报告	下载数据