这是发展有机体的版本;对于稳定版本,请参阅有机体。
生物导体版本:开发(3.16)
该软件包可以通过利用这些软件包实现选择方法的事实来实现一个简单的统一接口到几个具有自己的架构的注释软件包。
作者:马克·卡尔森(Marc Carlson),赫维·帕格斯(HervéPagès),马丁·摩根(Martin Morgan)
维护者:bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>
引用(从r内,输入引用(“有机体”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version ='devel')biocmanager :: install(“ astrymismdbi”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“生物体”)
R脚本 | 有机体:注释包的元框架 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 注解,,,,基础设施,,,,软件 |
版本 | 1.39.1 |
在生物导体中 | Bioc 2.11(R-2.15)(10年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | R(> = 2.14.0),方法,生物基因(> = 0.15.10),AnnotationDbi(> = 1.33.15),GenomicFeatures(> = 1.39.4) |
进口 | 生物酶,,,,生物管理器,,,,基因组机(> = 1.31.13),图形,,,,iranges,,,,rbgl,,,,DBI,,,,S4VECTORS(> = 0.9.25),统计 |
链接 | |
建议 | 同性恋,,,,rattus.norvegicus,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19,,,,AnnotationHub,,,,fdb.ucsc.trnas,,,,mirbase.db,,,,rtracklayer,,,,Biomart,,,,运行,,,,rmariaDB |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | 同性恋,,,,mus.musculus,,,,rattus.norvegicus |
进口我 | AnnotationHubdata,,,,epivizrdata,,,,GGBIO,,,,GPART,,,,发现 |
建议我 | Chippeakanno,,,,EPIVIZRSTANTALLONE |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | Armisismdbi_1.39.1.tar.gz |
Windows二进制 | 有机体dbi_1.39.1.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | 有机体dbi_1.39.1.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/organismdbi |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/astryismdbi |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/organismdbi/ |
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