ppinfer

doi：10.18129/b9.bioc.ppinfer

这是发展Ppinfer的版本；对于稳定版本，请参阅ppinfer。

使用蛋白质相互作用网络推断功能相关的蛋白质

生物导体版本：开发（3.16）

蛋白质之间的相互作用发生在许多（如果不是大多数）生物过程中。大多数蛋白质在与其他蛋白质和其他生物分子相关的网络中执行其功能。这一事实激发了各种实验方法的发展，以鉴定蛋白质相互作用。这种品种反过来又迎来了许多不同的计算方法来建模和预测蛋白质相互作用。有时，实验旨在鉴定与一些有趣的蛋白质密切相关的蛋白质。一种基于网络的统计学习方法用于从PPI网络上其相邻蛋白的已知功能推断蛋白质的假定功能。该软件包确定了这种蛋白质通常参与相同或相似的生物学功能。

作者：Dongmin Jung，Xijin GE

维护者：dongmin jung

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version ='devel'）biocmanager :: install（“ ppinfer”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ ppinfer”）

PDF	R脚本	用户手册
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	基因烯，，，，GraphandNetwork，，，，网络，，，，NetworkEnrichment，，，，途径，，，，软件，，，，统计信息
版本	1.23.0
在生物导体中	Bioc 3.5（R-3.4）（5年）
执照	艺术2.0
要看	Biomart，，，，fgsea，，，，克恩拉布，，，，GGPLOT2，，，，Igraph，，，，StringDB，，，，Yeastexpdata
进口	httr，grdevices，图形，统计，utils
链接
建议
系统要求
增强
URL
取决于我	GSEAN
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	ppinfer_1.23.0.tar.gz
Windows二进制	ppinfer_1.23.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	ppinfer_1.23.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ppinfer
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/ppinfer
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/ppinfer/
软件包下载报告	下载统计