Path2PPI

DOI:10.18129 / B9.bioc.Path2PPI

这是发展Path2PPI版本;稳定发布版本请参见Path2PPI．

通路相关蛋白-蛋白相互作用网络预测

Bioconductor版本:开发(3.16)

用于预测目标生物中蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络的包，其中只有关于PPIs的视图信息可用。Path2PPI根据一系列蛋白质来预测PPI网络，这些蛋白质可能属于已经建立的模型生物的某个通路。它有助于将某一途径或生物过程的信息从多个参考生物组合和转移到一个目标生物。Path2PPI仅依赖于所涉及蛋白质的序列相似性。

作者:Oliver Philipp, Ina Koch [ctb]

维护者:Oliver Philipp

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("Path2PPI")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“Path2PPI”)

超文本标记语言	R脚本	Path2PPI -一个简短的教程
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	网络，NetworkInference，通路，蛋白质组学，软件，SystemsBiology
版本	1.27.0
Bioconductor自	BioC 3.2 (R-3.2)(6.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.2.1),igraph(> = 1.0.1)方法
进口
链接
建议	knitr，rmarkdown，RUnit，BiocGenerics，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.bioinformatik.uni-frankfurt.de/
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	Path2PPI_1.27.0.tar.gz
Windows二进制	Path2PPI_1.27.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	Path2PPI_1.27.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Path2PPI
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ Path2PPI
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/Path2PPI/
包下载报告	下载数据