Pharmacogx

doi:10.18129/b9.bioc.pharmacogx

这是发展Pharmacogx的版本;对于稳定版本,请参阅Pharmacogx

大规模药物基因组数据的分析

生物导体版本:开发(3.16)

包含一组功能,以对药物基因组数据进行大规模分析。其中包括用于存储药物基因组实验结果的药物对象,以及计算药物剂量反应的常见摘要的许多功能,并将其与癌细胞线中的分子特征相关联。

作者:Petr Smirnov [aut],Zhaleh Safikhani [aut],Christopher Eeles [aut],Mark Freeman [Aut],Benjamin Haibe-Kains [Aut,CRE]

维护者:本杰明·海布·卡因斯

引用(从r内,输入引用(“ Pharmacogx”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ Pharmacogx”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Pharmacogx”)

PDF R脚本 创建药物对象
PDF R脚本 Pharmacogx:用于分析大型药物基因组学数据集的R包装
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 分类,,,,基因表达,,,,药物遗传学,,,,药物基因组学,,,,软件
版本 3.1.2
在生物导体中 Bioc 3.4(R-3.3)(5。5年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 3.6),coregx
进口 生物基因,,,,生物酶,,,,S4VECTORS,,,,总结性特征,,,,多亚sayExexperiment,,,,生物比较,,,,GGPLOT2,,,,魔术,,,,rcolorbrewer, 平行,表情, 方法,下载器,统计,utils,图形,grdevices,RESHAPE2,,,,jsonlite,,,,Data.Table,,,,检查员,,,,引导,,,,鸡舍
链接 RCPP
建议 潘德,,,,rmarkDown,,,,尼特,,,,编织,,,,蜡笔,,,,测试,,,,降价
系统要求
增强
URL
BugReports https://github.com/bhklab/pharmacogx/issues
取决于我
进口我 Xeva
建议我 有毒
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Pharmacogx_3.1.2.2.tar.gz
Windows二进制 Pharmacogx_3.1.2.2.zip
MacOS 10.13(高山脉) Pharmacogx_3.1.2.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pharmacogx
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/pharmacogx
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/pharmacogx/
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