pi

doi:10.18129/b9.bioc.pi

这是发展PI的版本;对于稳定版本,请参阅pi

利用遗传证据在基因和途径水平上优先考虑药物靶标

生物导体版本:开发(3.16)

优先指数或PI作为基因组领导的目标优先系统开发。它整合了功能性基因组预测因素,网络连通性和免疫本体论的知识,以优先在基因和途径水平上进行潜在的药物靶标。

作者:Hai Fang,Ultra-DD财团,Julian C Knight

维护者:hai fang

引用(从r内,输入引用(“ pi”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(decon ='devel')biocmanager :: install(“ pi”)的用法

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ pi”)

html R脚本 PI用户手册(R/Bioconductor包)
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 基因表达,,,,遗传学,,,,遗传学,,,,Genomewideassociation,,,,GraphandNetwork,,,,,,,,Linkagedisequilibrium,,,,网络,,,,途径,,,,软件
版本 2.9.0
在生物导体中 Bioc 3.4(R-3.3)(5。5年)
执照 GPL-3
要看 Igraph,,,,dnet,,,,GGPLOT2,图形
进口 矩阵,,,,基因组机,,,,GenomeInfodB,,,,Suprahex,,,,,grdevices,Ggrepel,,,,rocr,,,,Randomforest,,,,Glmnet,,,,格子,,,,商在,,,,plot3d,统计,方法,大量的,,,,iranges,,,,生物基因,,,,dplyr,,,,花花公子,,,,ggnetwork,,,,OSFR,,,,rcircos,,,,purrr,,,,readr,,,,蒂布尔
链接
建议 foreach,,,,多帕尔,,,,生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,PNG,,,,ggally,,,,栅格,,,,GGFORCE,,,,fgsea,,,,rcolorbrewer,,,,ggpubr,,,,rtracklayer,,,,GGBIO,,,,GVIZ,,,,data.tree,,,,jsonlite
系统要求
增强
URL http://pi314.r-forge.r-project.org
BugReports https://github.com/hfang-bristol/pi/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 pi_2.9.0.tar.gz
Windows二进制 pi_2.9.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) pi_2.9.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pi
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/pi
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/pi/
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