这是发展PI的版本;对于稳定版本,请参阅pi。
生物导体版本:开发(3.16)
优先指数或PI作为基因组领导的目标优先系统开发。它整合了功能性基因组预测因素,网络连通性和免疫本体论的知识,以优先在基因和途径水平上进行潜在的药物靶标。
作者:Hai Fang,Ultra-DD财团,Julian C Knight
维护者:hai fang
引用(从r内,输入引用(“ pi”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(decon ='devel')biocmanager :: install(“ pi”)的用法
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ pi”)
html | R脚本 | PI用户手册(R/Bioconductor包) |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 基因表达,,,,遗传学,,,,遗传学,,,,Genomewideassociation,,,,GraphandNetwork,,,,嗝,,,,Linkagedisequilibrium,,,,网络,,,,途径,,,,软件 |
版本 | 2.9.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.4(R-3.3)(5。5年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | Igraph,,,,dnet,,,,GGPLOT2,图形 |
进口 | 矩阵,,,,基因组机,,,,GenomeInfodB,,,,Suprahex,,,,秤,grdevices,Ggrepel,,,,rocr,,,,Randomforest,,,,Glmnet,,,,格子,,,,商在,,,,plot3d,统计,方法,大量的,,,,iranges,,,,生物基因,,,,dplyr,,,,花花公子,,,,ggnetwork,,,,OSFR,,,,rcircos,,,,purrr,,,,readr,,,,蒂布尔 |
链接 | |
建议 | foreach,,,,多帕尔,,,,生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,PNG,,,,ggally,,,,栅格,,,,GGFORCE,,,,fgsea,,,,rcolorbrewer,,,,ggpubr,,,,rtracklayer,,,,GGBIO,,,,GVIZ,,,,data.tree,,,,jsonlite |
系统要求 | |
增强 | |
URL | http://pi314.r-forge.r-project.org |
BugReports | https://github.com/hfang-bristol/pi/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | pi_2.9.0.tar.gz |
Windows二进制 | pi_2.9.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | pi_2.9.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pi |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/pi |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/pi/ |
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