qfeatures

doi:10.18129/b9.bioc.qfeatures

这是发展Qfeatures的版本;对于稳定版本,请参阅qfeatures

质谱数据的定量特征

生物导体版本:开发(3.16)

QFeatures基础架构可以为高通量质谱分析的定量特征进行管理和处理。它提供了熟悉的生物导体用户体验,可以以相干且可拖动的格式管理不同测定水平(例如肽光谱匹配,肽和蛋白质)的定量数据。

作者:Laurent Gatto [AUT,CRE],Christophe Vanderaa [aut]

维护者:laurent Gatto

引用(从r内,输入引用(“ qfeatures”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version ='devel')biocmanager :: install(“ qfeatures”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Qfeatures”)

html R脚本 来自qfeatures对象的数据可视化
html R脚本 处理定量蛋白质组学数据与qfeatures
html R脚本 质谱数据的定量特征
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 基础设施,,,,质谱,,,,代谢组学,,,,蛋白质组学,,,,软件
版本 1.7.0
在生物导体中 Bioc 3.12(R-4.0)(1。5年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 4.0),多亚sayExexperiment
进口 方法,统计,utils,S4VECTORS,,,,iranges,,,,总结性特征,,,,生物基因,,,,蛋白质(> = 1.19.3),AnnotationFilter,,,,懒惰,,,,生物酶,,,,mscoreutils(> = 1.1.2),Igraph,,,,情节
链接
建议 Singlecellexperiment,,,,HDF5Array,,,,MSDATA,,,,GGPLOT2,,,,GPLOTS,,,,dplyr,,,,林玛,,,,马格里特,,,,DT,,,,闪亮的,,,,发光的dashboard,,,,测试,,,,尼特,,,,生物使用,,,,rmarkDown,,,,VSN,,,,预处理,,,,矩阵,,,,IMPUTELCMD,,,,pcamethods,,,,,,,,规范,,,,复杂的图像
系统要求
增强
URL https://github.com/rformassspectrometry/qfeatures
BugReports https://github.com/rformassspectrometry/qfeatures/issues
取决于我 MSQROB2,,,,SCP,,,,scpdata
进口我 代谢通道,,,,psmatch
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 qfeatures_1.7.0.tar.gz
Windows二进制 qfeatures_1.7.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) qfeatures_1.7.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/qfeatures
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/qfeatures
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/qfeatures/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户