R453plus1toolbox

doi：10.18129/b9.bioc.r453plus1toolbox

这是发展R453plus1toolbox的版本;对于稳定版本，请参阅R453plus1toolbox。

用于导入和分析罗氏基因组序列系统数据的软件包

生物导体版本：开发（3.16）

R453PLUS1工具箱包括有用的功能，用于分析Roche的454测序平台生成的数据。它为质量保证以及检测到的变体的注释和可视化添加了功能，并补充了Roche与其产品一起运送的软件工具。此外，还提供了检测结构变体的管道。

作者：汉斯·乌尔里希·克莱因（Hans-Ulrich Klein），克里斯托夫·巴滕哈根（Christoph Bartenhagen），克里斯蒂安

维护者：hans-ulrich klein

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化了Bioc Devel Biocmanager :: install（version（version ='devel'）biocmanager :: install（“ r453plus1toolbox”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ R453plus1toolbox”）

PDF	R脚本	用于导入和分析罗氏基因组序列系统数据的软件包
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	DataImport，，，，datarepresentation，，，，基础设施，，，，QualityControl，，，，报告写作，，，，测序，，，，软件，，，，可视化
版本	1.47.0
在生物导体中	Bioc 2.7（R-2.12）（11。5年）
执照	LGPL-3
要看	r（> = 2.12.0），方法，变体（> = 1.25.11），生物弦（> = 2.47.6），生物酶
进口	UTILS，GRDEVICES，图形，统计，工具，Xtable，，，，R2HTML，，，，Deachertimos，，，，生物基因，，，，S4VECTORS（> = 0.17.25），iranges（> = 2.13.12），xvector，，，，基因组机（> = 1.31.8），总结性特征，，，，Biomart，，，，BSGENOME（> = 1.47.3），rsamtools，，，，Shortread（> = 1.37.1）
链接
建议	rtracklayer，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19，，，，BSGENOME.SCEREVISIAE.UCSC.SACCER2
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	r453plus1toolbox_1.47.0.tar.gz
Windows二进制	r453plus1toolbox_1.47.0.zip（仅64位）
MacOS 10.13（高山脉）	r453plus1toolbox_1.47.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/r453plus1toolbox
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/r453plus1toolbox
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/r453plus1toolbox/
软件包下载报告	下载统计