rnamodr.ribomethseq

doi:10.18129/b9.bioc.rnamodr.ribomethseq

这是发展rnamodr.ribomethseq的版本;对于稳定版本,请参阅rnamodr.ribomethseq

通过Ribomethseq检测2'-O甲基化

生物导体版本:开发(3.16)

rnamodr.ribomethseq从用肋骨塞克方案产生的实验数据中实现了对RNA上2'-O甲基化的检测。该软件包构建在RNAMODR软件包的核心功能上,以检测高通量测序数据中修改的特定模式。

作者:Felix G.M.恩斯特[aut,cre],Denis L.J. LaFontaine [CTB,FND]

维护者:Felix G.M.ernst

引用(从r内,输入引用(“ rnamodr.ribomethseq”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化了Bioc Devel Biocmanager :: install(version(version ='devel')biocmanager :: install(rnamodr.rebobomethseq”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ rnamodr.ribomethseq”)

html R脚本 rnamodr.ribomethseq
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 测序,,,,软件,,,,可视化,,,,工作流程
版本 1.11.0
在生物导体中 Bioc 3.10(R-3.6)(2。5年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 4.0),rnamodr(> = 1.5.3)
进口 方法,S4VECTORS,,,,生物基因,,,,iranges,,,,基因组机,,,,GVIZ
链接
建议 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,rtracklayer,,,,rnamodr.data
系统要求
增强
URL https://github.com/felixernst/rnamodr.ribomethseq
BugReports https://github.com/felixernst/rnamodr.ribomethseq/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 rnamodr.ribomethseq_1.11.0.tar.gz
Windows二进制 rnamodr.ribomethseq_1.11.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) rnamodr.ribomethseq_1.11.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rnamodr.ribomethseq
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/rnamodr.ribomethseq
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/rnamodr.ribomethseq/
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