RSVSIM

doi：10.18129/b9.bioc.rsvsim

这是发展RSVSIM的版本;对于稳定版本，请参阅RSVSIM。

RSVSIM：用于模拟结构变化的R/生物导体包装

生物导体版本：开发（3.16）

RSVSIM是用于模拟删除，插入，倒置，串联功能和易位的任何基因组中的删除，插入，倒置，串联功能和易位的软件包，该基因组可作为fasta-file或bsgenome数据包可用。SV断点可以均匀地放置整个基因组，对重复区域和高同源性区域（用于HG19）或用户支持的坐标有偏见。

作者：克里斯托夫·巴滕哈根（Christoph Bartenhagen）

维护者：Christoph Bartenhagen

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version ='devel'）biocmanager :: install（“ rsvsim”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ rsvsim”）

PDF	R脚本	RSVSIM：用于模拟结构变化的R/生物导体包装
PDF		参考手册

细节

生物浏览	测序，，，，软件
版本	1.37.0
在生物导体中	Bioc 2.12（R-3.0）（9年）
执照	LGPL-3
要看	r（> = 3.5.0），生物弦，，，，基因组机
进口	方法，iranges，，，，Shortread
链接
建议	bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19.大量的，，，，rtracklayer
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	rsvsim_1.37.0.tar.gz
Windows二进制	RSVSIM_1.37.0.ZIP
MacOS 10.13（高山脉）	rsvsim_1.37.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rsvsim
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/rsvsim
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/rsvsim/
软件包下载报告	下载统计