RTN

doi：10.18129/b9.bioc.rtn

这是发展RTN的版本;对于稳定版本，请参阅RTN。

RTN：转录调节网络的重建和调节分析

生物导体版本：开发（3.16）

转录调节网络（TRN）由转录因子（TFS）和受调节靶基因组成。TF是识别特定DNA序列并指导基因组表达的调节剂，可以激活或抑制靶基因的表达。由相同TF控制的基因组形成了调节量。该软件包提供了重建TRN和调节分析的类和方法。

作者：Clarice Groeneveld [CTB]，Gordon Robertson [CTB]，Xin Wang [aut]，Michael Fletcher [aut]，Florian Markowetz [aut]，Kerstin Meyer [aut]和Mauro Castro [aut]

维护者：毛罗·卡斯特罗（Mauro Castro）

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ rtn”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ RTN”）

html	R脚本	RTN：转录调节网络的重建和监管分析。”
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	基因表达，，，，结肠管制，，，，基因烯，，，，遗传因素，，，，GraphandNetwork，，，，网络，，，，NetworkEnrichment，，，，网络引导，，，，软件，，，，转录
版本	2.21.0
在生物导体中	Bioc 2.13（R-3.0）（9年）
执照	艺术2.0
要看	R（> = 3.6.3），方法
进口	Reder，，，，模丝，，，，毒蛇，，，，混音工具，，，，雪，统计林玛，，，，Data.Table，，，，iranges，，，，Igraph，，，，S4VECTORS，，，，总结性特征，，，，车，，，，PWR，，，，pheatmap，grdevices，图形，utils
链接
建议	运行，，，，生物基因，，，，生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown
系统要求
增强
URL	http://dx.doi.org/10.1038/ncomms3464
取决于我	Fletcher2013b，，，，rtnduals，，，，rtnsurvival
进口我
建议我	Geneplast
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	rtn_2.21.0.tar.gz
Windows二进制	rtn_2.21.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	rtn_2.21.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rtn
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/rtn
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/rtn/
软件包下载报告	下载统计