RankProd

DOI:10.18129 / B9.bioc.RankProd

这是发展RankProd版本;稳定的发布版本,请参阅RankProd。

产品排名的方法识别差异表达基因在荟萃分析中的应用

Bioconductor版本:发展(3.16)

识别差异表达的非参数方法(向上或向下-监管)基因的基础上估计错误预测的百分比(pfp)。该方法可以结合来自不同来源的数据集(荟萃分析)增加识别的力量。

作者:弗朗西斯科·德尔·Carratore < francesco.delcarratore manchester.ac。英国>哪Jankevics <哪。jankevics gmail.com > Fangxin香港< fxhong jimmy.harvard.edu >、<本Wittner Wittner。Ben mgh.harvard.edu > Rainer灵< Rainer。灵manchester.ac。Florian Battke英国>和< Battke在informatik.uni-tuebingen.de >

维护人员:弗朗西斯科·德尔·Carratore < francescodc87 gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“RankProd”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

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PDF	R脚本	RankProd教程
PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	DifferentialExpression,GeneExpression,GeneSignaling,Lipidomics,代谢组学,微阵列,蛋白质组学,ResearchField,软件,StatisticalMethod,SystemsBiology
版本	3.23.0
Bioconductor自	BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 17年)
许可证	文件许可证
取决于	R(> = 3.2.1),统计数据,方法,Rmpfr,gmp
进口	图形
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	tRanslatome
进口我	POMA,synlet
建议我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	RankProd_3.23.0.tar.gz
Windows二进制	RankProd_3.23.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	RankProd_3.23.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RankProd
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ RankProd
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/RankProd/
包下载报告	下载数据