repviz

doi：10.18129/b9.bioc.repviz

这是发展repviz的版本;对于稳定版本，请参阅repviz。

基因组区域的复制定向可视化

生物导体版本：开发（3.16）

repviz以简单有效的方式使基因组区域的视图。REPVIZ允许同时查看研究条件的测序计数中的内部和组间变化，及其与用户选择的数据分析方法的输出功能（例如确定的峰）进行比较。REPVIZ工具主要是为染色质数据设计的，例如作为chip-seq和atac-seq，但也可以与其他测序数据（例如RNA-SEQ）或不同类型的基因组数据组合一起使用。

作者：Thomas Faux，KalleRytkönen，Asta Laiho，Laura L. Elo

维护者：thomas faux，at asta laiho

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（decon ='devel'）biocmanager :: install（“ repviz”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ repviz”）

html	R脚本	repviz
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	Atacseq，，，，chipseq，，，，覆盖范围，，，，基因组变量，，，，测序，，，，软件，，，，可视化，，，，工作流程
版本	1.13.0
在生物导体中	Bioc 3.9（R-3.6）（3年）
执照	GPL-3
要看	r（> = 3.5.1），基因组机（> = 1.30.0），rsamtools（> = 1.34.1），iranges（> = 2.14.0），Biomart（> = 2.36.0），S4VECTORS（> = 0.18.0），图形，grdevices，utils
进口
链接
建议	rmarkDown，，，，尼特，，，，测试
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	repviz_1.13.0.tar.gz
Windows二进制	repviz_1.13.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	repviz_1.13.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/repviz
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/repviz
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/repviz/
软件包下载报告	下载统计