Risa

DOI:10.18129 / B9.bioc.Risa

这是发展Risa版本;稳定发布版本请参见Risa．

将ISA-tab中的实验元数据转换为Bioconductor数据结构

Bioconductor版本:开发(3.16)

以制表符分隔的调查/研究/分析(ISA)格式是一种通用框架，用于收集和交流复杂的元数据(例如，样品特征、使用的技术、测量类型)，这些元数据来自使用多种技术的实验，从传统方法到高通量技术不等。Risa允许访问ISA-Tab格式的元数据/数据，并构建Bioconductor数据结构。目前，微阵列、流式细胞术和基于代谢组学(即质谱)的分析生成的数据得到了支持。该软件包是可扩展的，正在努力支持与蛋白质组学分析相关的元数据。

作者:Alejandra Gonzalez-Beltran, Audrey Kauffmann, Steffen Neumann, Gabriella Rustici, ISA团队

维护者:Alejandra Gonzalez-Beltran < Alejandra .gonzalez。——gmail.com >

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("Risa")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes (Risa)

PDF	R脚本	Risa:将ISA-tab中的实验元数据转换为Bioconductor数据结构
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释，DataImport，MassSpectrometry，软件
版本	1.39.0
Bioconductor自	BioC 2.11 (R-2.15)(10年)
许可证	LGPL
取决于	R (> = 2.0.9),Biobase(> =测试盒框)、方法Rcpp(> = 0.9.13),biocViews，affy
进口	xcms
链接
建议	faahKO(> = 1.2.11)
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.isa-tools.org/
BugReports	https://github.com/ISA-tools/Risa/issues
取决于我
进口我
建议我	mtbls2
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	Risa_1.39.0.tar.gz
Windows二进制	Risa_1.39.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	Risa_1.39.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Risa
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ Risa
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/Risa/
包下载报告	下载数据