rnaseqsamples

doi：10.18129/b9.bioc.rnaseqsamples

此软件包适用于生物导体的3.16版。该软件包已从生物导体中删除。有关最后一个稳定的最新版本版本，请参阅rnaseqsamples。

rnaseqsamples

生物导体版本：开发（3.16）

RNASEQSAMPLASE软件包提供了一种基于负二项式模型的样本量计算方法，并提供了评估RNA-Seq数据差异表达分析的精确测试。它控制着多个测试的FDR，并利用了从真实数据的平均读取计数和分散分布来估算更可靠的样本量。它还配备了几个独特的功能，包括对感兴趣的基因或途径的估计，功率曲线可视化和参数优化。

作者：Shilin Zhao开发人员[AUT，CRE]，Chung-i Li [aut]，Yan Guo [aut]，Quanhu Sheng [aut]，Yu Shyr [aut]

维护者：shilin zhao开发人员

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ rnaseqsamples”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ rnaseqsamplesize”）

PDF	R脚本	rnaseqsamples：通过真实数据估计样本量
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	差异性，，，，实验设计，，，，基因表达，，，，免疫学，，，，rnaseq，，，，测序，，，，软件
版本	2.7.0
在生物导体中	Bioc 3.1（R-3.2）（7年）
执照	GPL（> = 2）
依靠	r（> = 4.0.0），GGPLOT2，，，，rnaseqsamplesizedata
进口	Biomart，，，，EDGER，，，，heatmap3，matlab，keggrest，方法，grdevices，图形，统计信息，RCPP（> = 0.11.2），叙事，，，，ggpubr，，，，总结性特征，，，，花花公子，，，，dplyr，，，，tidyselect，UTILS
链接	RCPP
建议	生物使用，，，，尼特，，，，测试
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	rnaseqsamplesize_2.7.0.tar.gz
Windows二进制	rnaseqsamplesize_2.7.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	rnaseqsamplesize_2.7.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rnaseqsamplesize
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/rnaseqsamplesize
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/rnaseqsamplesize/
软件包下载报告	下载统计