这是发展RSAMTOOLS的版本;对于稳定版本,请参阅rsamtools。
生物导体版本:开发(3.13)
该软件包提供了用于操纵SAM(序列对齐 / MAP),FASTA,二进制变体呼叫(BCF)和压缩索引索引索引Tab-Delimimited(TABIX)文件的“ Samtools”,“ BCFTools”和“ Tabix”实用程序的接口。
作者:Martin Morgan,HervéPagès,Valerie Obenchain,Nathaniel Hayden
维护者:bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>
引用(从r内,输入引用(“ rsamtools”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)#以下初始化了Bioc Devel Biocmanager :: Install(vaster(version ='devel')biocmanager :: install(“ rsamtools”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ RSAMTOOLS”)
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源包 | rsamtools_2.7.1.tar.gz |
Windows二进制 | rsamtools_2.7.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | rsamtools_2.7.1.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rsamtools |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/rsamtools |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/rsamtools/ |
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