SEtools

DOI:10.18129 / B9.bioc.SEtools

这是发展SEtools版本;稳定发布版本请参见SEtools．

SEtools:用于使用summarizeexperiment的工具

Bioconductor版本:开发(3.16)

这包括一组使用summarizeexperiment类的工具，包括合并、熔化和聚合函数。这个包中的绘图函数已经被移到了sechm包中。

作者:Pierre-Luc Germain [cre, aut]

维护者:Pierre-Luc Germain < Pierre-Luc。Germain在hester .ethz.ch>

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("SEtools")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“SEtools”)

超文本标记语言	R脚本	SEtools
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression，软件
版本	1.11.0
在Bioconductor公司	BioC 3.10 (R-3.6)(2.5年)
许可证	GPL
取决于	R (>= 4.0)
进口	BiocParallel，矩阵，SummarizedExperiment，DESeq2，S4Vectors，data.table，刨边机，openxlsx统计数据,股东价值分析，sechm
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，ggplot2
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/plger/SEtools
全靠我
进口我
建议我
给我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	SEtools_1.11.0.tar.gz
Windows二进制	SEtools_1.11.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	SEtools_1.11.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/SEtools
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/SEtools
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/SEtools/
软件包下载报告	下载数据