Seqvartools

doi：10.18129/b9.bioc.seqvartools

这是发展Seqvartools的版本；对于稳定版本，请参阅Seqvartools。

变体数据的工具

生物导体版本：开发（3.14）

SEQARRAY中提供的VCF数据的快速访问存储格式的接口，并提供用于常见操作和分析的工具。

作者：斯蒂芬妮·戈加滕（Stephanie M. Gogarten），Xiuwen Zheng，Adrienne Stilp

维护者：Stephanie M. Gogarten

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）＃以下初始化了Bioc Devel Biocmanager :: Install（version（version ='devel'）biocmanager :: install（“ seqvartools”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Seqvartools”）

PDF	R脚本	Seqvartools简介
PDF	R脚本	Seqvartools中的迭代器
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	遗传因素，，，，遗传学，，，，SNP，，，，测序，，，，软件
版本	1.31.0
在生物导体中	Bioc 2.13（R-3.0）（7。5年）
执照	GPL-3
要看	Seqarray
进口	grdevices，图形，统计，方法，生物酶，，，，生物基因，，，，GDSFMT，，，，基因组机，，，，iranges，，，，S4VECTORS，，，，gwasexacthw，，，，logistf，，，，矩阵，，，，Data.Table
链接
建议	生物使用，，，，运行，，，，Stringr
系统要求
增强
URL	https://github.com/smgogarten/seqvartools
取决于我
进口我	创世纪，，，，variantexperiment
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	seqvartools_1.31.0.tar.gz
Windows二进制	seqvartools_1.31.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	seqvartools_1.31.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/seqvartools
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/seqvartools
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/seqvartools/
软件包下载报告	下载统计