西格克

doi：10.18129/b9.bioc.sigcheck

这是发展Sigcheck的版本；对于稳定版本，请参阅西格克。

检查基因签名的预后性能，针对随机签名，已知签名和排列数据/元数据

生物导体版本：开发（3.16）

虽然基因特征经常用于预测表型（例如预测癌症患者的预后），但并不总是清楚它们的最佳或有意义（CF David Venet，Jacques E. Dumont和Vincent Detours的纸张“大多数随机基因表达）”与乳腺癌结局显着相关”）。基于该论文的建议，Sigcheck接受数据集（作为表达组）和基因特征，并将其在生存和/或分类任务上的性能与A）与A）相同长度的随机基因签名进行比较；b）已知，相关和无关的基因特征；c）排列的数据和/或元数据。

作者：Rory Stark 和Justin Norden

维护者：Rory Stark

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ sigcheck”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Sigcheck”）

PDF	R脚本	检查与Sigcheck的随机和已知特征的基因表达签名
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	分类，，，，基因表达，，，，基因烯，，，，软件
版本	2.29.0
在生物导体中	Bioc 3.0（R-3.1）（7。5年）
执照	艺术2.0
要看	r（> = 3.2.0），mlinterfaces，，，，生物酶，，，，E1071，，，，生物比较，，，，生存
进口	图形，统计，utils，方法
链接
建议	生物使用，，，，乳腺癌，，，，Qusage
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	sigcheck_2.29.0.tar.gz
Windows二进制	sigcheck_2.29.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	sigcheck_2.29.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sigcheck
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/sigcheck
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/sigcheck/
软件包下载报告	下载统计