这是发展SimBindProfiles版本;稳定发布版本请参见SimBindProfiles.
Bioconductor版本:开发(3.16)
SimBindProfiles识别基因组平铺阵列数据中常见和唯一的绑定区域。这个包不依赖于峰值调用,而是直接比较在同一数组平台上处理的绑定配置文件。它实现了一个简单的阈值方法,因此允许检索数据集之间的通用和差异绑定区域,以及补偿和增加绑定的事件。
作者:贝蒂娜·费舍尔,恩里科·费列罗,罗伯特·斯托尼克,史蒂夫·拉塞尔
维护者:Bettina Fischer
引用(从R中,输入引用(“SimBindProfiles”)
):
要安装此包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用bio devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("SimBindProfiles")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“SimBindProfiles”)
R脚本 | SimBindProfiles:类似的绑定Profiles,识别阵列基因组平铺阵列数据中的公共和唯一区域 | |
参考手册 |
biocViews | 微阵列,软件 |
版本 | 1.35.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.13 (R-3.0)(9年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R(>= 2.10),方法,林格 |
进口 | limma,mclust,Biobase |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | SimBindProfiles_1.35.0.tar.gz |
Windows二进制 | SimBindProfiles_1.35.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | SimBindProfiles_1.35.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SimBindProfiles |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SimBindProfiles |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/SimBindProfiles/ |
包下载报告 | 下载数据 |
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Bioconductor
支持»
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