SimBindProfiles

DOI:10.18129 / B9.bioc.SimBindProfiles

这是发展SimBindProfiles版本;稳定发布版本请参见SimBindProfiles

类似的绑定配置文件

Bioconductor版本:开发(3.16)

SimBindProfiles识别基因组平铺阵列数据中常见和唯一的绑定区域。这个包不依赖于峰值调用,而是直接比较在同一数组平台上处理的绑定配置文件。它实现了一个简单的阈值方法,因此允许检索数据集之间的通用和差异绑定区域,以及补偿和增加绑定的事件。

作者:贝蒂娜·费舍尔,恩里科·费列罗,罗伯特·斯托尼克,史蒂夫·拉塞尔

维护者:Bettina Fischer

引用(从R中,输入引用(“SimBindProfiles”)):

安装

要安装此包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用bio devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("SimBindProfiles")

对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“SimBindProfiles”)

PDF R脚本 SimBindProfiles:类似的绑定Profiles,识别阵列基因组平铺阵列数据中的公共和唯一区域
PDF 参考手册

细节

biocViews 微阵列软件
版本 1.35.0
Bioconductor自 BioC 2.13 (R-3.0)(9年)
许可证 GPL-3
取决于 R(>= 2.10),方法,林格
进口 limmamclustBiobase
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包 SimBindProfiles_1.35.0.tar.gz
Windows二进制 SimBindProfiles_1.35.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) SimBindProfiles_1.35.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SimBindProfiles
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SimBindProfiles
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/SimBindProfiles/
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