躯体签名

doi：10.18129/b9.bioc.somaticsignatures

这是发展版本的somaticsignatures；对于稳定版本，请参阅躯体签名。

躯体签名

生物导体版本：开发（3.16）

体积签名包可以确定单核苷酸变体（SNV）的突变特征。它提供了与Nik-Zainal（2012，细胞）中描述的方法相关的基础架构，并具有矩阵分解算法的灵活性。

作者：朱利安·盖林（Julian Gehring）

维护者：julian gehring

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ somaticsignatures'devel'）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ somaticsignatures”）

html	R脚本	躯体签名
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	聚类，，，，基因组变量，，，，测序，，，，软件，，，，somaticmmut，，，，统计信息，，，，可视化
版本	2.33.0
在生物导体中	Bioc 2.14（R-3.1）（8年）
执照	麻省理工学院 +文件执照
要看	r（> = 3.5.0），变体，，，，基因组机，，，，NMF
进口	S4VECTORS，，，，iranges，，，，GenomeInfodB，，，，生物弦，，，，GGPLOT2，，，，GGBIO，，，，RESHAPE2，，，，NMF，，，，pcamethods，，，，生物酶， 方法，代理人
链接
建议	测试，，，，尼特， 平行，bsgenome.hsapiens.1000genomes.hs37d5，，，，somaticccanceralterations，，，，ggdendro，，，，Fastica，，，，SVA
系统要求
增强
URL	https://github.com/juliangehring/somaticsignatures
BugReports	https://support.bioconductor.org
取决于我
进口我	yapsa
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	somaticsignatures_2.33.0.tar.gz
Windows二进制	somaticsignatures_2.33.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	somaticsignatures_2.33.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/somaticsignatures
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/somaticsignatures
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/somaticsignatures/
软件包下载报告	下载统计