结构视频隔离

doi：10.18129/b9.bioc.structuralvariantantation

这是发展构造体验的版本；对于稳定版本，请参阅结构视频隔离。

结构变体的变体注释

生物导体版本：开发（3.16）

结构体含量为分析生物导体生态系统内的结构变体提供了一个框架。该软件包包含用于处理VCF格式的结构变体的有用助手功能。这些软件包包含从许多受欢迎的呼叫者中解析VCF的功能，以及处理涉及两个单独基因组基因座的断点的功能，这些函数编码为Granges对象。

作者：Daniel Cameron [AUT，CRE]，破坏董[aut]

维护者：Daniel Cameron

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version（version ='devel'）biocmanager :: install（“ structuralVariantAnnotation”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ structuralVariantantation”）

html	R脚本	结构变体注释套件
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	注解，，，，DataImport，，，，遗传学，，，，测序，，，，软件，，，，变体
版本	1.13.0
在生物导体中	Bioc 3.9（R-3.6）（3年）
执照	GPL-3 +文件执照
要看	基因组机，，，，rtracklayer，，，，变体，，，，生物基因，r（> = 4.1.0）
进口	断言，，，，生物弦，，，，Stringr，，，，dplyr， 方法，rlang，，，，GenomicFeatures，，，，iranges，，，，S4VECTORS，，，，总结性特征，，，，GenomeInfodB
链接
建议	GGPLOT2，，，，DevTools，，，，测试（> = 2.1.0），roxygen2，，，，rmarkDown，，，，平淡无奇，，，，尼特，，，，GGBIO，，，，Biovizbase，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg19，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19
系统要求
增强
URL
取决于我	Svanumt，，，，Svaretro
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	structuralVariantAnnotation_1.13.0.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13（高山脉）
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/StructuralVariantAnnotation
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/structuralVariantAnnotation
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/StructuralVariantAnnotation/
软件包下载报告	下载统计