锡

DOI:10.18129 / B9.bioc.TIN

这是发展TIN版本;稳定版请参见锡．

转录组不稳定性分析

Bioconductor版本:开发(3.16)

TIN包实现了一套基于外显子表达谱的转录组不稳定性分析工具。在剪接因子的背景下研究外显子使用的偏差，以分析转录组不稳定性与剪接因子表达的相关程度。在转录组不稳定性相关分析中，将数据与选择性剪接得分的随机排列和随机基因集的表达进行比较。

作者:Bjarne Johannessen, Anita Sveen和Rolf I. Skotheim

维护者:Bjarne Johannessen

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("TIN")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“锡”)

PDF	R脚本	TIN封装介绍
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	AlternativeSplicing，DifferentialSplicing，ExonArray，GeneExpression，遗传学，微阵列，软件
版本	1.29.0
在Bioconductor	BioC 3.1 (R-3.2)(7.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 2.12.0)，data.table，嫁祸于，aroma.affymetrix
进口	WGCNA，南瓜，stringr
链接
建议	knitr，aroma.light，affxparser，RUnit，BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	TIN_1.29.0.tar.gz
Windows二进制	TIN_1.29.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	TIN_1.29.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TIN
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/TIN
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/TIN/
软件包下载报告	下载数据