这是发展版本的TRESS;稳定版请参见一绺头发.
Bioconductor版本:开发(3.16)
这个包专门用于分析MeRIP-seq数据。目前的功能包括1。转录组宽m6A甲基化区检测检测转录组宽差异m6A甲基化区域。
作者:郭振兴[aut, cre],吴浩[ctb]
维护者:郭振兴<振兴。郭在艾莫利大学>
引文(从R内,输入引用(“枝条”)
):
要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("TRESS")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“枝条”)
超文本标记语言 | R脚本 | 《女战士使用指南》 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | DifferentialMethylation,表观遗传学,PeakDetection,RNASeq,软件 |
版本 | 1.3.7 |
在Bioconductor | bio3.14 (R-4.1)(1年) |
许可证 | GPL-3 +文件许可证 |
取决于 | R(>= 4.1.0),平行,S4Vectors |
进口 | 跑龙套,rtracklayer,矩阵,matrixStats,统计,方法,图形,GenomicRanges,GenomicFeatures,IRanges,Rsamtools,AnnotationDbi |
链接 | |
建议 | knitr,rmarkdown,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | TRESS_1.3.7.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS 10.13 (High Sierra) | TRESS_1.3.7.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TRESS |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/TRESS |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/TRESS/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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