TarSeqQC

DOI:10.18129 / B9.bioc.TarSeqQC

这是发展TarSeqQC版本;稳定发布版本请参见TarSeqQC．

靶向测序实验质量控制

Bioconductor版本:开发(3.16)

该包允许用r表示目标实验。这是基于当前包的，并包含函数来对这类实验进行质量控制和对序列区域的快速探索。生成一个xlsx文件作为输出。

作者:Gabriela A. Merino, Cristobal Fresno, Yanina Murua, Andrea S. Llera和Elmer A. Fernandez

维护者:加布里埃拉·美利奴<美利奴。在gmail.com gabriela33 >

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用bio devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("TarSeqQC")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	对齐，报道，DataImport，质量控制，测序，软件，TargetedResequencing，可视化
版本	1.27.0
Bioconductor自	BioC 3.2 (R-3.2)(6.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R(>= 3.5.1)，方法，GenomicRanges，Rsamtools(> = 1.9.2),ggplot2，plyr，openxlsx
进口	统计,grDevices跑龙套,S4Vectors，IRanges，BiocGenerics，reshape2，GenomeInfoDb，BiocParallel，Biostrings，cowplot、图形、GenomicAlignments，Hmisc
链接
建议	BiocManager，RUnit
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.bdmg.com.ar
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TarSeqQC
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ TarSeqQC
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/TarSeqQC/
包下载报告	下载数据