TrajectoryUtils

DOI:10.18129 / B9.bioc.TrajectoryUtils

这是发展trajectory yutils版本;稳定版请参见TrajectoryUtils．

单细胞轨迹分析实用程序

Bioconductor版本:开发(3.16)

实现用于单单元轨迹分析的低级实用程序，主要用于在高级包中重用。包含一个函数，用于创建集群级别的最小生成树和数据结构，以保存伪时间推断结果。

作者:Aaron Lun [aut, cre]， Kelly Street [aut]

维护者:Aaron Lun 的键盘

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install(" trajectory yutils ")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“TrajectoryUtils”)

超文本标记语言	R脚本	轨迹公用事业
PDF		参考手册

细节

biocViews	GeneExpression，SingleCell，软件
版本	1.5.0
在Bioconductor	BioC 3.13 (R-4.1)(1年)
许可证	GPL-3
取决于	SingleCellExperiment
进口	方法、统计数据矩阵，igraph，S4Vectors，SummarizedExperiment
链接
建议	BiocNeighbors，DelayedArray，DelayedMatrixStats，BiocParallel，testthat，knitr，BiocStyle，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	//www.andersvercelli.com/packages/TrajectoryUtils
BugReports	https://github.com/LTLA/TrajectoryUtils/issues
全靠我	弹弓，TSCAN
进口我	调味品，singleCellTK，tradeSeq
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	TrajectoryUtils_1.5.0.tar.gz
Windows二进制	TrajectoryUtils_1.5.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	TrajectoryUtils_1.5.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TrajectoryUtils
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ trajectory yutils
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/TrajectoryUtils/
软件包下载报告	下载数据