TurboNorm

DOI:10.18129 / B9.bioc.TurboNorm

这是发展TurboNorm版本;稳定发布版本请参见TurboNorm

一种适用于微阵列归一化的快速散点图平滑器

Bioconductor版本:开发(3.16)

一种基于二阶差分惩罚b样条的快速散点图平滑器。单色数据如Affymetrix/Illumina的微阵列归一化函数和作为marray marrayraw对象或limma rglist对象提供的双色数据都是可用的。

作者:Maarten van Iterson和Chantal van Leeuwen

维护:Maarten van Iterson

引用(从R中,输入引用(“TurboNorm”)):

安装

要安装此包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("TurboNorm")

对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“TurboNorm”)

PDF R脚本 TurboNorm概述
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews CpGIsland,DNAMethylation,MethylationArray,微阵列,归一化,OneChannel,预处理,软件,TwoChannel
版本 1.45.0
Bioconductor自 BioC 2.8 (R-2.13)(11.5年)
许可证 LGPL
取决于 R (> = 2.12.0),转换,limma(> = 1.7.0),marray
进口 grDevices统计数据,affy,晶格
链接
建议 BiocStyle,affydata
SystemRequirements
增强了
URL http://www.humgen.nl/MicroarrayAnalysisGroup.html
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包 TurboNorm_1.45.0.tar.gz
Windows二进制 TurboNorm_1.45.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) TurboNorm_1.45.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TurboNorm
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ TurboNorm
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/TurboNorm/
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