ACDE

doi：10.18129/b9.bioc.acde

这是发展ACDE的版本；对于稳定版本，请参阅ACDE。

人工成分检测差异表达基因

生物导体版本：开发（3.16）

该软件包提供了一种多元推论分析方法，用于检测基因表达数据中差异表达的基因。它使用人工组件，靠近数据的主要成分，但在差异遗传表达方面具有精确的解释，以识别差异表达的基因，同时控制错误的发现率（FDR）。该软件包上的方法在Vignette或文章的“在基因表达实验中推断出差异表达基因的多变量方法”中描述了J. P. P. Acosta，L。L。Lopez-Kleine和S. Restrepo（2015年，待发表）。

作者：Juan Pablo Acosta，Liliana Lopez-Kleine

维护者：unal.edu.co>的Juan Pablo Acosta

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（decon ='devel'）biocmanager :: install（“ acde”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ ACDE”）

PDF	R脚本	用人工组件鉴定差异表达的基因
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	差异性，，，，基因表达，，，，微阵列，，，，委托人，，，，软件，，，，时间科，，，，Mrnamicroarray
版本	1.27.0
在生物导体中	Bioc 3.2（R-3.2）（6。5年）
执照	GPL-3
要看	r（> = 3.3），引导（> = 1.3）
进口	统计，图形
链接
建议	生物基因，，，，运行
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我	coexnet
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	acde_1.27.0.tar.gz
Windows二进制	acde_1.27.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	acde_1.27.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/acde
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/acde
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/acde/
软件包下载报告	下载统计