affyplm

doi：10.18129/b9.bioc.affm

这是发展Affyplm的版本；对于稳定版本，请参阅affyplm。

拟合探针级模型的方法

生物导体版本：开发（3.16）

扩展并改善基本象征包的功能的软件包。大量使用编译代码的例程。中心重点是实施使用这些模型拟合探针级模型和工具的方法。基于PLM的质量评估工具。

作者：Ben Bolstad

维护者：Ben Bolstad

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version ='devel'）biocmanager :: install（“ affyplm”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ affyplm”）

PDF	R脚本	Affyplm：Maplot功能的高级使用
PDF	R脚本	affyplm：拟合探针级别模型
PDF	R脚本	Affyplm：基于模型的Affymetrix Genechips评估
PDF	R脚本	affyplm：threestep功能
PDF		参考手册

细节

生物浏览	微阵列，，，，Onechannel，，，，预处理，，，，QualityControl，，，，软件
版本	1.73.0
在生物导体中	Bioc 1.6（R-2.1）或更早（> 17.5岁）
执照	GPL（> = 2）
要看	r（> = 2.6.0），生物基因（> = 0.3.2），副词（> = 1.11.0），生物酶（> = 2.17.8），GCRMA，统计预处理（> = 1.5.1）
进口	Zlibbioc，图形，grdevices，方法
链接	预处理
建议	Affydata，，，，大量的
系统要求
增强
URL	https://github.com/bmbolstad/affyplm
取决于我	refplus
进口我	affylmgui，，，，ArrayQualityMetrics，，，，mimager
建议我	arraymvout，，，，生物基因，，，，Frmatools，，，，metahdep，，，，钢琴
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	affyplm_1.73.0.tar.gz
Windows二进制	affyplm_1.73.0.zip（仅64位）
MacOS 10.13（高山脉）	affyplm_1.73.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/affyplm
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/affyplm
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/affyplm/
软件包下载报告	下载统计